副業の確定申告のやり方｜会社員がスマホとe-Taxで終わらせる手順【2026年版】

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「副業で確定申告が必要なのは分かった。でも、結局なにをどの順番でやればいいのか」。本記事はその一点に答える、副業の確定申告の実作業の手順書です。

「申告が必要かどうか」「雑所得と事業所得のどちらで出すか」「青色と白色どちらを選ぶか」といった判断は、別記事「副業の確定申告ガイド【義務ではなく権利。青色と白色の選び方】」で整理しています。この記事を読んで方針が決まったあとに、本記事で「具体的にどう手を動かすか」をたどってください。

結論を先に言うと、いまの副業の確定申告は、準備 → 集計 → e-Tax送信 → 納税・還付の4フェーズで、税務署に行かずスマホだけでも完結できます。順番に見ていきます。

結論：副業の確定申告は「4フェーズ」で終わる

会社員の副業の確定申告は、次の流れに分解できます。

準備フェーズ：必要書類を4点そろえる
集計フェーズ：会計ソフトで収入・経費・控除を集計する
送信フェーズ：e-Tax（スマホ or PC）で申告書を作成・送信する
精算フェーズ：納税する、または還付を受け取る

紙の申告書を手書きし、税務署の窓口に並ぶ時代の手順を思い浮かべている方ほど、実際の作業の軽さに拍子抜けするかもしれません。日々の帳簿づけさえできていれば、申告書の作成・送信は数十分で終わります。

本記事は2026年5月時点の一般的な手順の整理です。税制・申告方法は改正や運用変更があるため、最終的な税額計算や個別ケースの判断は、必ず税理士・税務署・専門家にご相談ください。

全体スケジュール：いつ何をやるか

手順に入る前に、年間の時間軸を押さえます。「2月になってから慌てる」を避けるのが、副業の確定申告で最も効くコツです。

確定申告の期間

所得税の確定申告期間は、原則として毎年2月16日〜3月15日です（最終日が土日祝なら翌平日に繰り延べ）。直近の令和7年分（2025年分）の申告は、3月15日が日曜だったため**2026年2月16日（月）〜3月16日（月）**でした（国税庁）。

e-Tax（電子申告）の受付は、確定申告期間中は土日祝を含めて24時間可能です。税務署の開庁時間を気にする必要はありません。

還付だけなら2月を待たなくてよい

副業の経費や控除で「払いすぎた所得税が戻ってくる（還付）」だけのケースなら、2月16日を待たずに申告できます。還付申告の期限は対象年の翌年1月1日から5年間あるため、急いで提出する必要もありません（国税庁）。納税が発生する場合のみ、3月15日（前述の繰り延べ含む）の期限を意識してください。

納税のタイミング

納税が発生する場合、納付期限は申告期限と同じです。口座振替（振替納税）を選んでおくと、引き落としは申告期限より後ろにずれます（令和7年分は2026年4月23日が振替日）。手元資金の都合がある方は振替納税の登録を検討してください。

フェーズ1：必要書類を4点そろえる（準備）

申告作業を始める前に、次の4点を手元に用意します。これがそろっていれば、あとの作業は迷いません。

本業の源泉徴収票：勤務先から年末〜1月に交付されます。給与収入と源泉徴収税額を申告書に転記（または自動取得）します
副業の収入と経費の記録：1年分の入金額と、経費にしたレシート・請求書。後述の会計ソフトに日々入れていれば、ここは集計済みの状態になります
各種控除の証明書：生命保険料控除証明書、ふるさと納税の寄附金受領証明書、医療費の領収書など。本業の年末調整で適用済みのものは重複させません
マイナンバーカード＋読み取り対応スマホ：e-Taxで送信するための本人確認に使います

TIP

副業の収入・経費の記録は、年末にまとめてやろうとすると一年分のレシート分類で丸2日溶けます。月に一度、銀行・カード連携で取り込んだ取引を分類しておくと、申告期に「集計はもう終わっている」状態を作れます。

フェーズ2：会計ソフトで集計する【PR】

副業の収入と経費を、確定申告書の形に集計するフェーズです。ここを手作業の表計算でやると消耗するため、クラウド型の確定申告ソフトを使うのが現実的です。銀行口座・クレジットカードを連携すれば取引が自動で取り込まれ、「これは経費／これは事業外」を分類するだけで、申告に必要な集計（青色申告なら決算書も）が自動で組み上がります。

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代表的な2サービスの位置づけを、手順の観点で整理します。

項目	マネーフォワードクラウド確定申告	やよいの青色申告オンライン
最安プラン	パーソナルミニ：年10,800円	セルフプラン：初年度0円／次年度11,800円
無料で試す	1か月無料トライアル（クレカ不要）	初年度無償キャンペーン（要決済情報登録・自動更新）
向いている人	ME（家計簿）など他のMF系を既に使っている／将来法人化も視野	まず費用を抑えて始めたい／シンプルに使いたい

集計フェーズの作業自体はどちらも「連携 → 取引分類 → 申告書出力」で同じです。すでにマネーフォワード系のサービスを使っているならマネーフォワード、初年度の費用を最小化したいならやよい、という選び方が分かりやすいです。どちらも無料で試せるので、UIを触って決めても遅くありません。

なお、副業所得が20万円以下で確定申告そのものが不要なケースもあります（詳しくは「副業の20万円ルール」を参照）。「キャンペーンが無料だから契約する」ではなく、「自分に申告が必要か → 必要なら無料で試す」の順で判断してください。

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フェーズ3：e-Taxで作成・送信する（スマホで完結）

集計が終わったら、申告書を作成してe-Taxで送信します。会計ソフトからそのままe-Tax送信する方法と、国税庁「確定申告書等作成コーナー」で作成する方法がありますが、ここではスマホで完結する基本手順を整理します。

用意するもの

マイナンバーカード
マイナンバーカードの読み取りに対応したスマートフォン
マイナポータルアプリ（事前にインストール）
マイナンバーカード発行時に設定した2種類のパスワード：利用者証明用電子証明書（数字4桁）と、署名用電子証明書（英数字6〜16文字）

送信までの手順

マイナポータルアプリからe-Taxにアクセスし、マイナンバーカードをスマホで読み取って認証する
マイナポータル連携を使うと、給与の源泉徴収票・医療費・ふるさと納税などのデータを一括取得し、申告書の該当項目へ自動入力できる（対応している控除のみ）
副業の収入・経費・控除を入力する（フェーズ2で会計ソフトに集計済みなら、その数字を転記または取り込む）
署名用電子証明書で電子署名を付与して送信する
受付番号を保存する（送信完了の控え。万一の問い合わせ時に必要）

NOTE

スマホ用電子証明書（スマホ自体にマイナンバーカード機能を載せる仕組み）に対応すると、申告のたびにカードをスマホで読み取る手間が不要になります。Android端末では既に利用でき、iPhoneでも令和8年（2026年）1月から「iPhoneのマイナンバーカード」が利用できるようになりました（国税庁・デジタル庁）。

副業会社員が忘れやすい1ステップ

副業を会社に知られたくない場合、申告書の**「住民税に関する事項」で住民税の徴収方法を「自分で納付（普通徴収）」に設定**するのを忘れないでください。これを選ばないと副業分の住民税も給与天引き（特別徴収）に合算され、住民税額のズレから会社に副業を察知されることがあります。仕組みの詳細は「副業が会社にバレる仕組み」で解説しています。

フェーズ4：納税する、または還付を受け取る

送信が終わったら最後の精算です。

還付の場合：指定した口座に振り込まれます。e-Taxで申告すると、書面提出より処理が早い傾向があります（時期は混雑状況によります）
納税の場合：口座振替（振替納税）、ダイレクト納付、クレジットカード納付、コンビニ納付（QRコード）、e-Taxからのインターネットバンキングなど、複数の方法から選べます。期限は申告期限と同じです

ここまで完了すれば、その年の副業の確定申告は終わりです。

副業ならではのつまずきポイント

手順そのものよりも、副業特有の「判断」でつまずく人が多いポイントを挙げておきます。いずれも本記事の範囲を超える論点なので、それぞれの専門記事に判断を委ねます。

そもそも申告が必要か（20万円ルール）：所得税と住民税で扱いが違います →「副業の20万円ルール」
雑所得か事業所得か／青色か白色か：節税幅と手間が変わる重要な分岐です →「副業の確定申告ガイド」
開業届を出すべきか：青色申告を狙うなら関係します →「副業で開業届を出すべきか」

「やり方（手順）」と「判断」を切り分けて進めると、作業が一気に整理されます。

よくある質問

マイナンバーカードがなくてもe-Taxで申告できますか

税務署で発行する「ID・パスワード方式」を使えばマイナンバーカードなしでも送信できますが、事前に税務署での本人確認が必要です。これから始めるなら、マイナンバーカード方式のほうが手続きが完結しやすく、マイナポータル連携による自動入力も使えます。

スマホがマイナンバーカード読み取りに対応していない場合は

ICカードリーダーを接続したパソコンから、確定申告書等作成コーナーで作成・送信できます。会計ソフト経由でのe-Tax送信も同様にパソコンで可能です。

申告期限に間に合わなかったら

期限後でも申告（期限後申告）はできますが、無申告加算税や延滞税が発生する場合があります。気づいた時点で早めに申告するのが、追加負担を抑える基本です。詳細な取り扱いは税務署・税理士に確認してください。

まとめ：手順は「準備 → 集計 → 送信 → 精算」

副業の確定申告のやり方を、実作業の順にたどりました。要点を整理します。

全体は準備 → 集計 → e-Tax送信 → 納税・還付の4フェーズ
準備するのは源泉徴収票・副業の収入経費・控除証明書・マイナンバーカード＋スマホの4点
集計はクラウド会計ソフトに任せると、申告書がほぼ自動で組み上がる
送信はマイナポータルアプリ＋マイナンバーカードでスマホ完結
会社に知られたくないなら普通徴収の選択を忘れない
還付だけなら2月16日を待たずに申告でき、期限を急ぐ必要もない

「やるか／どの区分で出すか」の判断が済んでいない方は、先に「副業の確定申告ガイド」で方針を固めてから、本記事の手順に戻ってきてください。

集計フェーズを軽くしたい方へ

手順のなかで唯一まとまった時間がかかるのが集計です。クラウド会計ソフトは銀行・カード連携で取引を自動取得するため、ここを大きく短縮できます。紹介した2サービスはどちらも無料から試せます。